Одной из ключевых проблем чиновники называют изношенность ирригационной инфраструктуры. Большая часть каналов и объектов построены 35–80 лет назад и физически устарели.

Общая потребность в инвестициях оценивается в 216,3 миллиарда сомов.

Поскольку основная часть водоканалов построена в земляном русле, это приводит к значительным потерям воды при транспортировке.

Проблемами названы и недостаточные темпы строительства и модернизации ирригационной инфраструктуры, слабое внедрение передовых технологий, водосберегающих решений, автоматизации и цифровизации.

Также отмечено, что за последние 35 лет в Кыргызстане не было построено значимого количества водохранилищ. При этом при дефиците поливной воды в вегетационный период значительная часть зимнего стока рек уходит без использования внутри страны.

Система управления водными ресурсами, сформированная еще в советский период, устарела и требует институциональных изменений, отмечается в проекте.

В питьевом водоснабжении и водоотведении также подчеркивается высокий уровень физического и морального износа водопроводных и канализационных сетей.

По данным департамента развития питьевого водоснабжения и водоотведения, жители 273 сел не имеют доступа к централизованному водоснабжению. Большинство населенных пунктов не обеспечено централизованными системами водоотведения и очистки сточных вод. Во многих из них население использует выгребные ямы для сбора сточных вод.

Указано, что Закон «О питьевой воде» не в полной мере соответствует действующему законодательству, а комплексное регулирование в сфере водоотведения отсутствует.

Среди проблем также отмечены климатические риски, включая засуху, наводнения и деградацию источников водоснабжения.