Функции владельца и оператора системы возложены на Государственный таможенный комитет (ГТК). Согласно указу, система будет интегрирована в платформу "Правительственное облако", что обеспечит надежность и безопасность данных.

Министерство цифрового развития и транспорта совместно с Государственной службой специальной связи и информационной безопасности должно обеспечить реализацию мер, вытекающих из требований указа президента от 12 сентября 2018 года "Об утверждении Правил формирования, ведения, интеграции и архивирования государственных информационных ресурсов и систем, а также о некоторых мерах, связанных с электронным правительством". Вместе с государственными органами (учреждениями), формирующими первичные источники информации, указанной в Положении, министерство в течение шести месяцев должно принять необходимые меры для обеспечения доступа к этой информации через Информационную систему электронного правительства.

Внедрение "Интеллектуальной таможни" направлено на оптимизацию государственного управления в сфере внешней торговли. Использование передовых информационно-коммуникационных технологий позволит упростить процессы таможенного контроля и оформления товаров и транспортных средств, а также ускорит взаимодействие с участниками внешнеэкономической деятельности. Кроме того, система обеспечит качественную аналитику, позволяющую формировать точные прогнозы и отчеты.

Вся информация и электронные документы, накапливаемые в рамках İGİS, признаются государственной собственностью, а защита персональных данных пользователей будет осуществляться строго в соответствии с законодательством Азербайджана. Финансирование мероприятий по созданию, управлению и развитию системы предусмотрено за счет средств государственного бюджета, а также других источников, не запрещенных законом.